Codex 智能助手
对话接本机 Codex · 可调用服务器资源 / 查知识库 / 修 bug / 提交计算
检测中…
👋 你好，我是接在本机 Codex 上的智能助手
可以直接用中文下指令：查平台数据、跑脚本、调服务器资源、修 bug、提交 CP2K 计算……
- 查一下平台知识库里有哪些 CP2K 参数经验
- 看看当前服务器上有哪些计算在跑、占了多少资源
- 帮我分析一个上传的结构文件（先点左下角 📎 上传）
研究体系 Systems
管理 PEM 电解水催化材料体系（Ir/Ru 基合金、掺杂、吸附构型）及其结构参数与描述符，作为结构生成、计算与机器学习的统一数据源。
体系列表
0结构查看器
未选择文献库 Literature
汇集 PEM 电解水阳极 / 阴极催化剂顶刊文献，解析材料体系、结构与性能数据，为成分设计与活性-稳定性权衡提供证据支撑。
自动从 CrossRef 获取元数据、从 OpenAlex / Semantic Scholar 拉取摘要；勾选「AI 解读」将用大模型提取材料体系、性能与结论并归档到知识库（需已配置模型）。
CP2K 知识库 Knowledge Base
沉淀 CP2K 计算设置要点与输入经验，来源区分 官方手册 与 思想家公社（Sobereva）博文，供参数查询与排错参考。
ASE 结构生成 Builder
以参数化方式快速构建表面 slab、合金、掺杂与吸附结构，实时 3D 预览，并导出 .cif/.xyz 入库或交付计算。
晶胞与表面参数
ASE · ase.buildÅ
Å
×
合金 / 掺杂
50%
1-based 原子序号（替换该原子）
吸附物种
Å · 距表面
如 5.0, 4.5 · 支持后续自定义位点
3D 预览
未生成
鼠标交互：
点击原子 → 设为掺杂位点
拖拽旋转 · 滚轮缩放 · 点击按当前模式生效
晶胞信息
| 尚未生成结构 |
CP2K 输入推荐 Recommender
结合知识库推荐关键计算参数，调用 Multiwfn 真实生成各类计算（GEO_OPT / ENERGY / PDOS / MD 等）的 CP2K 输入，支持在线编辑与关键词合法性校验。
Multiwfn 生成输入文件
真实调用 Multiwfn自定义参数（可选，未添加的按 Multiwfn 默认）
可添加理论方法 / 基组 / 密度混合 / k 点网格 / SCCS 溶剂化 / TDDFT 等；仅填写的参数会传给 Multiwfn，其余保持默认。
Multiwfn 默认 PBE + DZVP-MOLOPT-SR-GTH + GTH-PBE + 350/50 Ry 截断，生成结果填入下方可编辑输入块，供学习各计算类型的默认参数设置。SCF 求解方法：Diagonalization（对角化，金属/带隙均适用）与 OT（Orbital Transformation，非金属带隙体系推荐，收敛快，不支持 smearing）。
可编辑输入块 · 实时校验
待校验
基组 / 赝势
统一：所有元素共用同一文件；逐个：不同元素可用不同文件与计算级别，&DFT 会按需列出多个文件名（CP2K 允许多个文件，不报错）。
全参数设置 Full Parameters
完整覆盖 CP2K 官方 Input Reference 的全部 SECTION / KEYWORD（数据由 CP2K 2026.2 源码生成），可逐项细调默认值、单位、枚举与说明。
SECTION 树
—请选择左侧 SECTION
实时校验预览 · 独立编辑器
待校验
与「输入推荐」的编辑器相互独立、互不影响，可在此独立编写并校验 CP2K 输入文本（实时高亮 + 行号 + 关键词合法性）；「导入结构」与输入推荐一致，从结构生成 / 内置示例导入结构生成输入文件。
计算任务 CP2K Tasks
提交并监控独立 CP2K 计算任务（mpirun 直连）与 AiiDA 进程，实时查看服务器资源占用；高通量链式工作流已统一在高通量筛选模块启动。
本平台已提交任务
0含「独立 CP2K 任务」（mpirun 直连，按 PID 杀进程树）与「工作流计算任务」（AiiDA，按 PK 调
verdi process kill）。点击停止即可终止对应进程。运行中的进程
0最近进程
0进程资源监控
ps 脚本化检索 · vtop 同类计算任务（MPI 启动器聚合）
CP2K 进程明细
本面板用
ps 脚本化检索进程的 CPU 使用率 / 内存占用率 / 运行时间；如需交互式视图，可在服务器终端运行 vtop 查看。CP2K 视图 CP2K View
内置 CP2K View，可视化结构 / 轨迹 / 输入 / 输出，含 SCF 收敛曲线、几何优化轨迹、能量分解与 INP 结构树等分析视图。
cp2k_runs/
高通量筛选 HTS
高通量工作流一站式平台：ASE 批量生成结构 → 经 AiiDA 依次提交结构优化 / 单点能 / PDOS / Bader → 实时监控 → 回收结果构建 ML 数据集；支持 A 逐结构链式与 B 波前并行两种执行模式。
计算工作流 · 平台已提交
0平台工作流任务：运行中可点■ 停止（终止其 AiiDA 计算，verdi process kill）；已终止/失败/完成的任务可点删除移除记录。
高通量批次
0批量工作流（ASE 批量结构 × 多步骤）：每行一个批次，点开可查看各结构计算状态；运行中可■ 终止，结束后可收集数据集（CSV 保存到提交时指定路径）或删除。
工作流结构 · 正在计算的结构
0展示活跃工作流的父子进程树：顶层 WorkChain → 中间节点 → 正在计算的 CP2K 结构（可点「详情」查看 PK 并检索）。
进程时间线
完成运行等待异常/终止
机器学习 ML
基于材料描述符做特征归因与活性-稳定性关联分析，训练回归 / 分类模型，并将计算结果标注为可供主动学习调用的 ML 数据集。
训练任务监控
0 个
训练以后台任务运行（支持 GPU 双卡并行）：可查看实时进度与日志、终止运行中的任务、删除失败/已终止的条目。
SHAP 特征归因
—活性-稳定性火山图
Pareto 前沿数据集概览
数据来源与数据集构建
说明 · 点击展开▸
主动学习 Active Learning
以 GPR 代理模型给出预测值与不确定性，按 UCB 采集函数推荐下一批高价值候选结构，闭环反馈至高通量计算，加速催化剂筛选。
主动学习任务监控
0 个预测值 - 不确定性
GPR · RBF 核（浏览器拟合）下一批推荐结构
UCB 采集函数数据说明
来源 · 点击展开▸
势函数延拓 DPGEN
基于 DP-GEN 主动学习闭环，通过"训练 → 探索采样 → 高精度标注 → 扩充数据集 → 评估收敛"循环，持续延拓机器学习势函数（深度势能 DP）的精度与适用体系，支撑反应机理研究与逆向材料设计。
势函数延拓任务监控
0 个
闭环任务以后台编排线程运行（复用平台 CM- 队列做 CP2K 高精度标注、复用休go做误差分析与构型推荐）：可查看迭代进度、每轮指标、CP2K 标注任务、终止运行中任务或删除已结束记录。
迭代明细
未选择点击任务「明细」查看逐轮迭代、训练/验证误差与 CP2K 标注任务。